Ó tugadh isteach é sna 1970idí, tá forbairt agus feabhsú leanúnach déanta ar anailís mhiocróbach. Ar dtús, úsáideadh é go príomha le haghaidh samplaí comhshaoil a bhrath, agus ina dhiaidh sin leathnaíodh é de réir a chéile chuig réimsí na míochaine, na talmhaíochta, na bithinnealtóireacht, etc. Le dul chun cinn leanúnach na biteicneolaíochta, tá nuálaíocht agus feabhsú leanúnach déanta ar anailís mhiocróbach, ag éirí mar mhodh anailíse tábhachtach. .
